MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia valaisiana VS116 plasmid VS116_lp28-8

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012169	AGCCG	2	10	5	14	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_012169	T	7	7	58	64	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_012169	AAG	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012169	TAAA	2	8	98	105	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012169	AGA	2	6	109	114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012169	ATTC	2	8	115	122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_012169	ATT	2	6	145	150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012169	ACT	2	6	168	173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_012169	ATT	2	6	178	183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_012169	A	6	6	215	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_012169	ATG	2	6	245	250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012169	TAT	2	6	256	261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012169	AACA	2	8	269	276	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012169	TA	4	8	284	291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012169	AT	3	6	311	316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012169	CTAT	2	8	320	327	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_012169	A	8	8	355	362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_012169	TAAA	3	12	369	380	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012169	T	6	6	441	446	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_012169	CTT	2	6	468	473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_012169	A	6	6	502	507	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012169	TTA	2	6	508	513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_012169	AATC	2	8	527	534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_012169	AATT	2	8	580	587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_012169	TTA	2	6	622	627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012169	ATA	2	6	635	640	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012169	CATA	2	8	677	684	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_012169	TCTATT	2	12	714	725	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_012169	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012169	ATTTA	2	10	802	811	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012169	A	6	6	826	831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012169	AAT	2	6	836	841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012169	AATT	2	8	852	859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012169	AAAT	2	8	901	908	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012169	GAT	2	6	915	920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012169	ATA	2	6	939	944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012169	A	6	6	944	949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012169	ATT	2	6	5545	5550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012169	T	6	6	5570	5575	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012169	TTTA	2	8	5579	5586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012169	ATT	2	6	5594	5599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_012169	AAG	2	6	5674	5679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012169	ATAG	2	8	5723	5730	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012169	A	6	6	5735	5740	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_012169	CCT	2	6	5752	5757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012169	TGT	2	6	5774	5779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012169	TAA	2	6	5782	5787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_012169	AAC	2	6	5788	5793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012169	ACA	2	6	5837	5842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_012169	ACC	2	6	5846	5851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_012169	A	6	6	5892	5897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012169	TAA	2	6	5908	5913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_012169	TTC	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012169	AAAAT	2	10	9967	9976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012169	TAACCT	2	12	10330	10341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_012169	A	6	6	11142	11147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012169	ACC	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_012169	AATA	2	8	11998	12005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012169	A	8	8	12027	12034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012169	T	6	6	12040	12045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012169	TAA	2	6	12056	12061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012169	TTA	2	6	12068	12073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012169	TA	3	6	12117	12122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012169	AT	3	6	12149	12154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_012169	A	6	6	12160	12165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012169	T	6	6	12166	12171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_012169	AT	3	6	12177	12182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012169	A	7	7	12190	12196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012169	A	8	8	13109	13116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012169	TAA	2	6	13153	13158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012169	ATT	2	6	13178	13183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_012169	TTAA	2	8	13216	13223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012169	T	6	6	13226	13231	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_012169	A	6	6	13238	13243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012169	TTAA	2	8	13246	13253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_012169	AAAAT	2	10	13339	13348	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012169	ATA	2	6	13359	13364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012169	A	6	6	13949	13954	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_012169	TTGTT	2	10	13958	13967	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012169	TA	4	8	16465	16472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_012169	AATT	2	8	16482	16489	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_012169	TGAA	2	8	16502	16509	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_012169	ATA	2	6	16522	16527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012169	TA	3	6	16526	16531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012169	TTAAG	2	10	16560	16569	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.